Andrzej Pepłoński jest cenionym autorem specjalizującym się w literaturze historycznej. Jego prace skupiają się na ważnych wydarzeniach i tajemnicach związanych z okresem Drugiej Rzeczypospolitej, szczególnie z tajną służbą w latach 1918-1944. Jego książki są cenione za rzetelność i głęboką analizę tematu, co czyni go jednym z istotnych głosów w dziedzinie historii Polski.
Jednym z najbardziej znanych jego dzieł jest książka „Wojna o tajemnice. W tajnej służbie Drugiej Rzeczypospolitej 1918-1944”, w której autor zagłębia się w kulisy działań wywiadowczych i tajnych operacji, ukazując ich znaczenie dla losów Polski w trudnych czasach.